Manipulación de tibbles con herramientas del Tidyverse
Datos generales
Código: tibbles
Duración: 2 horas
Nivel: Básico-Intermedio
Idioma: Español
Fecha: 24 de junio de 2022
Duración: 2 horas
Nivel: Básico-Intermedio
Idioma: Español
Fecha: 24 de junio de 2022
Horario: 16:00 a 18:00 (centro de México)
Modalidad: Online
Descripción:
Durante el curso se abordarán los siguientes temas:
- Estructura general de un tibble.
- Se dará un breve repaso a la estructura de un dataframe y su versión mejorada, los tibbles. En esta sección, se explicará la forma de cargar una base de datos desde un archivo .xlsx (Excel).
- El operador pipe (%>%).
- Se mostrará el funcionamiento del operador pipe (%>%) y explicará el razonamiento lógico de su aplicación para la concatenación de operaciones.
- Operaciones básicas sobre un tibble.
- Se dará una introducción a las herramientas de dplyr que permiten manipular los tibbles, tales como: arrange, count, mutate, filter, distinct, slice, select, pull, intersect, unión, setdiff. Se enfatizará en el aprovechamiento del operador pipe para economizar el código y darle un sentido lógico.
- Agrupamientos y análisis de datos por grupos.
- Se explicará la utilidad del uso de agrupamientos para el análisis fragmentado de los datos contenidos en un tibble, así como la obtención de nueva información a partir de los agrupamientos mediante summarise.
- Formatos largos y anchos de tibble.
- Se definirá la lógica detrás de los formatos anchos y largos de un tibble, y se darán ejemplos para transformar un tibble determinado en un formato y de regreso, con las funciones pivot_longer y pivot_wider, de la librería tidyr. También se explorarán las funciones unite, separate, drop_na, replace_na, fill.
Pre-requisitos:
- Es necesario tener nociones básicas de la estructura de un dataframes en R.
- Computadora con al menos 8 GB de memoria RAM
- Última versión de R instalada (v. 4.2.0) (https://cran.r-project.org/).
- Última versión de R Studio instalada (v. 2022.02.3+492) (https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/#download).
- Tener instalado el Tidiverse.
- En una sesión de R, ejecutar: install.packages("tidyverse").
- Aplicación de Zoom y conectividad a internet.
Para quién va dirigido este mini curso:
- El curso va dirigido a toda aquella persona que tenga conocimiento básico-intermedio del lenguaje de programación R, particularmente del concepto y creación de dataframes, así como algunas funciones básicas como max, min, length, nrow, table, colnames.
Detalles del evento:
- El evento será gratuito y exclusivo para miembros de la RMB.
- Las instrucciones de acceso serán enviadas el día del evento.
Actividades:
- 15:45 am a 16:00 pm: Conéctate a Zoom y configura tu micrófono
- 16:00 pm a 16:05 pm: Introducción de parte de la Red Mexicana de Bioinformática
- 16:05 pm a 16:15 pm: Código de conducta y cómo usar la plataforma de Zoom
- 16:15 pm a 16:25 pm: Estructura general de un tibble.
- 16:25 pm a 16:35 pm: El operador pipe (%>%).
- 16:35 pm a 17:20 pm: Operaciones básicas sobre un tibble.
- 17:20 pm a 17:30 pm: Agrupamientos y análisis por grupos.
- 17:30 pm a 18:00 pm: Formatos largos y anchos de tibble.
Organizadores:
Nodo Nacional de Bioinformática (NNB-CCG)
Formulario de registro:
Reseña del instructor
M. en C. David Felipe Rendón Luna
David es Candidato a Doctor en Ciencias Bioquímicas por la UNAM, y realiza sus estudios de posgrado en el Instituto de Biotecnología-UNAM, enfocándose en el estudio de la relación estructura-función de proteínas desordenadas de plantas en ambientes simulados de deshidratación in vitro. Está certificado como “Instructor” por la fundación The Carpentries, dedicada a la enseñanza de habilidades de programación y ciencia de datos. Ha participado en diversas ediciones de los Talleres Internacionales de Bioinformática (TIBs) organizados por el Nodo Nacional de Bioinformática-CCG, primero como participante y posteriormente como ayudante. Posee habilidades de análisis de datos y programación en R, Bash, Python y Perl, así como un desempeño óptimo en línea de comandos. Impartió el curso “Introducción a R y Graficación con ggplot” para el laboratorio del Dr. Cesar Cuevas Velázquez, de la Facultad de Química de la UNAM. Además, es violinista desde los 15 años de edad, está aprendiendo a tocar chelo, es un ávido lector de novelas de ciencia-ficción y de fantasía épica, y disfruta de la compañía de sus amigos.
